Датасет 1. Влияние выпаса скота на зообентос рек о.Тасмания

Из-за сельскохозяйственной деятельности поступление грунта и питательных веществ в реки увеличивается. Влияние, которое оказывают эти факторы сложно оценить по-отдельности без специальных экспериментов. Полевые наблюдения за сообществами макробентоса рек можно рассматривать как результат “естественного многолетнего эксперимента”, который оценивает влияние сельского хозяйства вцелом.

Tasmania

Чтобы проверить, как выпас скота в масштабах территории водосбора влияет на население дна рек, летом 2008–9 и 2009-10 были взяты пробы бентоса и измерены различные характеристики среды в 27 речных сайтах в северной Тасмании. Данные в файле Grazing_Magierowski_et_al_2015.xls: лист “env” — характеристики среды; лист “fauna” — фауна.

Задание 1

При помощи perMANOVA проверьте, меняется ли фауна в реках Тасмании в зависимости от уровня выпаса скота в зоне водосбора (переменная GrazingRank).

GrazingRank — доля территории водосбора, занятой выпасом скота (Low — 0-10%; Medium – 10-50%; Severe >50%)

Источник: Magierowski, RH, Davies, PE, Read, SM (2015). Biological and physical data collected from river sites selected across a gradient of catchment area under grazing in northern Tasmania., Version 1. http://doi.org/10.4227/05/54BEEE248D22B. ÆKOS Data Portal, rights owned by University of Tasmania. Accessed 02 Mar 2017.

Датасет 2. Гематология сонных ящериц Tiliqua rugosa

Физиологическое состояние живых существ часто используют для оценки качества среды. Делать такого рода измерения дешевле и проще на модельных объектах. Сонная ящерица Tiliqua rugosa — широко распространенный вид в южной Австралии. В частности, в районе Мюррей Мали, который является территорией интенсивного земледелия и скотоводства. Гематологические характеристики Tiliqua rugosa можно использовать для оценки качества среды.

Shingleback-sa.jpg
By Benjamint444 - Own work, GFDL 1.2, Link

Данные о гематологии ящериц собирали с сентября по ноябрь 2010 года в нескольких сайтах с разной степенью антропогенной модификации ландшафта (данные в файле Sleepy lizard.xlsx, лист “data”).

В немодифицированном ландшафте (Treatment 1) пробы собраны в одном районе исследования BS0 (Landscape.ID 1). В сильно модифицированном ландшафте (Treatment 2) пробы собраны в трех разных районах (Landscape.ID 1 — LS1, 3 — LS2, 5 — LS3).

Только в сильно модифицированном ландшафте в каждом из районов сайты были разделены на группы в зависимости от типа местообитания (Habitat: остатки естественной растительности, посадки лебеды, поля с зерновыми культурами или под паром) и от степени связи с участками естественной растительности (Connectivity: низкая — < 63%, средняя — 63-88%, высокая — 88%; полностью связанные участки).

У ящериц измеряли различные характеристики крови, из которых вам понадобятся:

  • Tot_WBC — общее число белых кровяных клеток
  • Het_ABS — общее число гетерофилов
  • Lym_ABS — общее число лимфоцитов
  • H:L Ratio — соотношение гетерофилов и лимфоцитов
  • Mon_ABS — число моноцитов
  • OthG_ABS — число прочих гранулоцитов

Известно, что гематологическая картина у ящериц зависит в том числе от общего физиологического состояния, которое косвенно можно оценить при помощи индекса, описывающего размеры тела, вернее, отклонение от обычных размеров (переменная LBSI — Linear Body Size Index, остаток от RMA-регрессии логарифма массы от логарифма длины тела).

Задание 2

Упрощенные варианты анализа:

a: Различается ли состав крови ящериц из немодифицированного и сильно модифицированного ландшафтов?

b: Проверьте, различается ли состав крови ящериц в разных местообитаниях в сильно модифицированном ландшафте

c: Проверьте, влияет ли степень связности на состав крови ящериц из сильно модифицированного ландшафта.

“Правильный”, наиболее полный вариант:

d: Влияют ли на состав крови ящериц из сильно модифицированного ландшафта тип местообитания и степень связности.

Источник: Smyth, A. K., Smee, E., Godfrey, S. S., Crowther, M., Phalen, D. (2014). Haematology of the Sleepy Lizard (Tiliqua rugosa) in Australia’s cereal croplands, 2010, Version 1.0. http://doi.org/10.4227/05/537C5C5553F9E. ÆKOS Data Portal, rights owned by University of Adelaide, University of Sydney, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation. Accessed 03 Mar 2017.

Creative Commons License
multivar by Marina Varfolomeeva, Vadim Khaitov, and Yuta tamberg is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.